Contexte

Un épitope ou déterminant antigénique est une petite structure chimique qui peut entrer en contact et être reconnue comme étrangère par l’organisme induisant alors une réponse immunitaire. Cette reconnaissance est donc à la base de la réponse immunitaire spécifique puisque ce mécanisme permet à l’organisme de différencier le soi du non soi.

Solution

WeStBEPred est un outil informatique qui identifie dans une séquence protéique, les régions immunogéniques (épitopes séquentiels) susceptibles d’être reconnues par les anticorps du système immunitaire.

Techniques et méthodes:

• Bio-informatique
• Apprentissage automatique
• Application web

Avantages

La connaissance des épitopes présente un intérêt fondamental dans:

• Les études biologiques & cliniques
• La découverte de nouveaux vaccins
• La prévention
• La conception de tests diagnostique
• Le traitement des maladies.

L’outil WeStBEPred a été utilisé avec succès dans le cadre d’un projet de développement d’un test de dépistage viral pour l’industrie aquacole (FISHGUARD)